基爾大學在以下七個研究機構中組織開展研究活動：
人文科學研究機構、法律、政治和司法研究機構、生命課程研究機構、公共政策和管理研究機構、環境、物理科學及應用數學研究機構（EPSAM）、醫學科學技術研究機構、基礎護理及健康科學研究機構自2005年起，研究和企業辦公室開始管理基爾大學的企業活動。
基爾大學于1973年引進標準的三年制學位課程，從那時起，入讀預科課程的學生開始減少。然而，預科課程并沒有停止發展，而是成為那些可以進入高等教育但缺乏升讀學位專業所需的專業學科資格的學生的很好選擇。相反，基爾大學的雙學位課程保持著其一貫的獨特性并受到學生的歡迎，大約90%的基爾大學本科學生選擇攻讀雙學位。
作為實驗性社區，基爾在創辦之初是一個全寄宿學校。在早年，基爾還因此被稱為”社會主義者學院“，”山上的克里姆林宮“。